Léo, 11 ans, passe ses journées cloué à son lit, dans un hôpital new-yorkais. Mais l'enfant malade possède aussi une faculté extraordinaire: celle de se dédoubler puis, sous une forme translucide, survoler la ville et franchir les obstacles, pendant que son corps physique semble rester endormi. Chemin faisant, le garçon croise Alex, un détective roublard et déterminé, qui se déplace en fauteuil roulant depuis qu'il a été victime de "l'Homme au visage cassé", un dangereux criminel qui projette de prendre le contrôle de New York au moyen d'un virus informatique. Pour contrecarrer cette sinistre machination, Léo, alias "Phantom Boy", s'associe à Alex, par l'entremise de la journaliste Mary Delauney.